以粗壮、肉厚、肥嫩,不霉、不虫蛀、无杂质为优质。有毒蘑菇的颜色比较浓艳,菌伞带有红、紫、黄或其它杂色斑点,基底红色,形状异常,发出辛辣、恶臭和苦味。
蘑菇是不易保存的食物,日子一久便为变黄,而荤伞背后也会变成褐色,如果经过加热,即使略带有褐色,也不必在意,但如果是生吃时,则应选购新鲜的蘑菇,切开之后淋上柠檬或醋,可防止其变色。另外,香蕈、蘑菇野生者要注意是否有毒,如中毒可用生绿豆和水研浓汁饮之遂解。
双孢菇采摘后菌盖容易通过氧化而由白变黄,购买时观察菌盖推测其新鲜程度。
有商贩通过使用硫磺熏蒸等方法为新鲜的双孢菇增白,在购买时需要注意。经常食用经过硫磺熏蒸的食品容易使得食道受伤。